Repositorio de Información Genética Uruguay

A nivel mundial, el conocimiento de la información genética está incrementándose exponencialmente gracias a los avances en tecnologías de secuenciación de genomas y transcriptomas. Nuestro país no es ajeno a esta revolución, existiendo varias instituciones que han incorporado dicha tecnología, y obteniéndose consecuentemente cada vez más datos sobre nuestra biodiversidad. En algunos casos esta información queda depositada en bases de datos internacionales, sin embargo, esto no siempre es así, quedando muchas veces a nivel del grupo que realizó el trabajo. 

En la presente propuesta, se plantea resguardar esta diversidad mediante la generación de un repositorio de recursos genéticos, inicialmente microbianos y de especies vegetales nativas. El mismo será creado en el seno de la Udelar y permitirá almacenar, procesar y distribuir la información, quedando disponible para consulta de forma gratuita y pública. Esto permitirá vincular grupos de investigación dentro del país, que puedan potenciar su conocimiento o sus áreas de expertise. Asimismo, el conocimiento de la institución e investigadores que trabajaron en cada caso posibilitará acceder al material biológico vinculado a una secuencia dada. 

En paralelo con este trabajo, se plantea el desarrollo de programas basados en workflows o en aprendizaje automático, para un mejor aprovechamiento de la información allí albergada. Como ejemplo, la búsqueda de nuevas enzimas puede verse favorecida por el desarrollo de workflows, modelos y simulaciones moleculares a fin de encontrar la mejor enzima candidata para una aplicación dada. Este tipo de estrategias también podrán aplicarse para detectar clusters biosintéticos asociados a la producción de un determinado metabolito microbiano o vegetal. Todas estas herramientas permiten hacer un aprovechamiento de los recursos genéticos con diferentes fines, racionalizando ensayos y facilitando la selección de metabolitos bioactivos y enzimas promisorios para diferentes aplicaciones.

Centro de Estudios Interdisciplinarios de Biodiversidad Orientada a aplicaciones en Salud